小豪：与詹姆斯为伍的勇气，你有吗？
1
为了拯救小豪，樱木博士与作为调查研究员的小智前往马洛克蒙集团的能源工厂，在救出小豪的途中，樱木博士被洛兹的宝可梦们杀死。
“大叔！”
小智痛苦得对着樱木博士喊道。
樱木博士从自己的头上取下鸭舌帽，放到小智头上。
洛兹的秘书奥莉薇追杀了过来，企图杀死小智一行人。
小智和小豪躲到楼梯口，小豪打开手中的箱子，放到小智面前，箱子里面放着四枚精灵球。
小豪问小智，“与詹姆斯为伍的勇气，你有吗？”
2
樱木博士是樱木研究所的所长，樱木研究所位于关东地区的枯叶市，作为半吊子调查研究员，小智像往常回到研究所，没想到在研究所里遇到了为了继承房子而来所长的女儿樱木春。
“你是大叔的女儿？”小智问。
小春此时并不知道自己的父亲已经死了，她以监视小智以及小豪为理由，当上了研究所的所长。
3
在伽勒尔地区，马洛克蒙集团暗地里在生产以及销售一种名叫极巨腕带的商品，并且一边收集许愿星，马洛克集团的首领洛兹认为未来地球的能源会用尽，因此必须利用无极汰那的力量。
极巨腕带可以使宝可梦极巨化，获得强大的战斗力，这也使那些不法分子有机可乘，伽勒尔地区经常出现极巨化宝可梦作乱的事件，为了调查这些事件，以及对抗马洛克蒙集团，调查研究员小智与小豪便会经常来往于关东以及伽勒尔。
4
每当遇到极巨化事件时，小豪就会在研究所用手机洛托姆查询资料，小智则负责去案发地，当与极巨化宝可梦交战时，小智便会掏出雷鸟龙，小智的意识将会进入雷鸟龙的头部，小豪的意识则会进入雷鸟龙的尾部，失去意识的小豪本人会倒下，这时候就需要小春将小豪的身体接住。
雷鸟，龙，海兽，鳃鱼，不同的部分可以随意进行拼接缝合成一只宝可梦。
比如组合成雷鸟龙，雷鸟海兽，鳃鱼龙，鳃鱼海兽。
5
我们是二人一心的调查研究员。
来细数你的罪恶吧。
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